作为前燕皇帝的慕容儁，一直在寻找机会搞死慕容垂以绝后患，但是都被战功卓着，威震领邦的慕容恪所阻。
然而作为前燕的帝国柱石，慕容恪不可能无时无刻保护着慕容垂，总有在外征战，顾及不到之时。
当时慕容垂娶了段部鲜卑的首领段末柸的女儿段氏为妻，段氏才高性烈，名声远播，与皇后可足浑氏不睦，被对方所忌。
经常吹枕边风的向慕容儁说对方的坏话，加上慕容儁对慕容垂也有除掉之心，两人一拍即合的开始对慕容垂夫妻进行布局。
没过多久，他们布局在慕容垂府上的下人举报段氏及吴国典书令高弼参与巫蛊，意图把慕容垂牵扯进来。
两人下狱后，被施加重刑，妄图屈打成招，然而两人始终“志气确然，终无挠辞”。
慕容垂非常心痛，暗中派人告诉妻子段氏：“每个人都会有一死，夫人不要在受此苦痛了，把我招了吧，我们夫妻二人一起走上黄泉，也算有个伴。”
其妻段氏扼腕叹息道：“谁又愿意受如此折磨而死？但是我们明明没有做此等祸国之事，如果自己诬告夫君为谋逆，既辱没了自己的祖宗，也对不起夫君的恩情，妾身绝对不会做这样的事情。”
没过多久，段氏熬不住酷刑，自尽于牢狱之中。
自此慕容垂与慕容儁、皇后可足浑氏一系结成了永远也化解不掉的死仇。
无法取得证据扳倒慕容垂，只能封他为平州刺史，以镇辽东，让对方远离燕国的核心区域。
为了纪念自己的妻子，慕容垂将段氏的妹妹纳为继室，皇后可足浑氏非常厌恶段氏部落的女人，又派人让慕容垂将自己的第二任妻子休掉，并将其妹妹嫁与慕容垂，这愈发的让慕容垂不甘。
虽然名义上休掉了自己第二任妻子，慕容垂依旧将其带在身边。
后来慕容垂随兄长慕容恪攻克洛阳，当时的慕容恪如日中天，没有人敢违逆他的意思。于是，慕容垂被封为征南大将军、荆州牧，都督黄河以南的十州军事，镇守南方，防止西边的苻秦与南方的晋朝。
慕容垂这些年跟在慕容恪身边所表现出来的军事实力深受兄长的惊讶与认可。
慕容恪临终之时，深知燕国的顽疾，皇帝慕容暐手中无实权，太后可足浑氏与辅政的慕容评会继续执掌大权，他们两人皆是无能之辈。
自己在世时，他们不敢僭越。自己去世后，无人可以限制他们，于是向皇帝慕容暐以及侄子乐安王慕容臧举荐了慕容垂。
病榻上的慕容恪虚弱的说道：“微臣通读史书，知道傅说这样的圣人举荐人才时，连板筑之人都可以胜任，更何况是国家的懿亲呢！慕容垂兼具文武之才，才能仅次于管仲、萧何，可以胜任大司马的职位。
我死之后，陛下可以用慕容垂治理国家并统领军队，苻秦与晋国绝对不敢侵犯我们，不然必能让对方有来无回。
而慕容垂也懂得燕国未来的发展方向，有他处理政务，必定会让国家安稳，即使有不臣的人犯上作乱，也能迅速平定。”