在清除了黄粉虫养殖场这个最大的已知源头后，[新杨城]里的疫情蔓延也似乎终于被抑制了。
当然，这可能也和巢执行了一系列更严格的措施有关。
如今，患病者一旦发现，不分阶层，一律被丢进几乎完全与外界隔绝的的隔离区内自生自灭，措施干脆果断。
而在发现养殖场的湿度很高，似乎这种真菌尤其喜欢高湿度环境后，主角又让在各个巢室都不定期生火烘烤，以降低环境湿度，破坏真菌的生存环境。
因为这些巢室的容积、通风条件等不适合点燃大火堆，只能点起大一些的火把。而这些火把必须含有油脂才能耐燃，纯木材或干草的火把就像划着的火柴一样一着就没。为此，又耗尽了巢储备的油脂。
主角甚至还计划过改建燃烧室的烟道，让其能够覆盖更大空间，利用燃烧废气的热量自动烘干巢穴。但这项工程工作量太大，为防疫已经抽调太多蚁力资源，实在抽不出蚁手开工，只能作罢。而在疫情结束后，这项工程终于启动，以一劳永逸的解决巢穴的潮湿问题。
而随着近期洪水稍稍退去，虽然还在洪水季，但河流已经安然过了最大的洪峰，地下水的水位也随之下降，巢穴里的潮湿度的降低，也有一部分自然的因素。
多重因素下，[新杨城]内的湿度终于显著下降。而多管齐下之下，发病者数量也逐步控制在了一天两位数，虽然没有杜绝传染，但能察觉到疫情的势头在消减。
现在让主角头大又心疼的，是如何救治隔离区里的那些蚂蚁，里面如今已经有大量蚂蚁，其中不乏螽豹这样的军团长，也不乏大量跟随主角南征北战的老兵，都是极其珍贵的蚁才。
在隔离区里，主角除了供应食水，几乎什么也做不了，只能期待患病蚂蚁的自身免疫力起作用。
每天都有一些蚂蚁因病死去，其他蚂蚁只能将shi体堆积在隔离区一角掩埋住，当一间巢室被shi体堆满后，就彻底掩埋起来，再开掘一处新的巢室来停shi。
主角曾经在发现黄粉虫养殖场隔壁的蝇蛆养殖场居然没有一例疫情发生后，非常欣喜。他知道苍蝇和蛆都有极强的免疫力，哪怕是在shi体上生存，吃各种腐肉等食物，也不会生病。
他觉得自己找到了抗击瘟疫的特效药，就急忙给隔离区提供了大量蝇蛆，让里面的蚂蚁涂抹分泌物，生吃蝇蛆肉，以这种办法了对抗瘟疫。
什么？提前做个实验验证下蝇蛆分泌物或肉的疗效？
主角根本没有时间做这些事情，面对每天数以百计的损失，总蚁口只有一万出头的[新杨城]根本等不及，也根本损失不起。
主角是抱着死马当活马医的心理，才提供蝇蛆给隔离区的，能不能有效就看天意吧。
幸运的是，之后隔离区的死亡数字的确有下降，但本身每天送进隔离区的病患也在减少，到底是蝇蛆有效，还是疫情在自然消退，主角也说不准。
这场疫情最终在6月下旬结束，连续三天没有出现新增患者和死者后，主角松了一口气。
隔离区仍将继续保留七天，到时候才会让里面少数幸存的蚂蚁出来。到时候隔离区将会经过彻底的烘烤消毒候，再彻底填满封闭。
这边将永远不会重新发掘，哪怕将来[新杨城]需要扩建，也绝对不会向这个扩展，这里将沦为后的小汤山医院一样的禁区。
这场瘟疫给[新杨城]和神使王军团带来了极大的损失。