在此后的几千年中，中医在医学领域“一枝独秀”。春秋战国时期中医理论已经基本形成，出现了解剖和医学分科，已经采用“四诊”，治疗法有砭石、针刺、汤药、艾灸、导引、布气、祝由等。
西汉时期，开始用阴阳五行解释人体生理，出现了“医工、金针、铜钥匙”等。东汉著名医学家张仲景，他已经对“化。废除古文，废除中文，废除中医，废除一切他们认为可以代表华夏文明的一切，恨不得把自己的老祖宗的根挖断。
在这种背景之下，在华夏医学史上，我国曾三次发生废除过中医的运动。
1879年，清末国学泰斗俞樾先生在其《废医论》中首次明确建议废除中医。俞樾先生认为中医的所有理论均建立在阴阳五行之上，辅以一些肺腑经络的学说，这是一件非常荒谬且愚昧的事情。
而俞樾先生的这一倡议顿时得到了晚清一大批学者的响应，比如著名学者严复认为“其例之立根于臆造，而非实测之所会通”，也就是说当时的学者对于中医的质疑基本上来源于对中国古代“玄学、巫术”也就是“迷信”的质疑。
当你连基本理论都是错误的时候，还怎么能去说建立其上的学科是正确的？
不过相较于其他学者，俞樾和严复已算是较为理性派，比如俞樾先生晚年的著作《医学说》则认为“医可废，而药不可废”，虽然他有着别人所没有的理性思维，但是“药不可废”依旧表明了那个时代以及一名国学研究者，而不是医学研究者的局限性。
在那个西医尚且存在着很多荒谬之处的年代里，当时的科学技术不可能从分子层面去分解中药材，而得出诸多中药才是身体健康最大的杀手的结论。
梁启超就曾激烈的抨击中医为“学术界之耻辱，莫此为甚矣！”
陈独秀更是在《新青年》报上撰文，“不解人身之构造，不事药性之分析，惟知附会五行生克寒热阴阳之说，其术殆与矢人同科。”在陈独秀看来“杀人以中医与弓，有以异乎？”
到了1912年，北洋政府颁布《壬子癸丑学制》，并将中医排除在正规教育系统之外。教育总长汪大燮公开表示“吾国医毫无科学概要根据、余决意今后废去中医，不用中药。所请立案一节，难以照准。”
上述两次废除中医运动还只是一部分人的提议，属于个人对中医的反对行为，对中医本身有冲击，但是危害不大。
而后北伐成功，在执行的汪精卫等人的鼓动下，废止中医的主张在1929年2月27日召开的“全国卫生工作部会议”获得通过。一时间举国哗然。为了挽救中医，社会各界人士纷纷行动，积极与废止中医派周旋，最终保住了“国粹”中医的地位。
这种前所未有的从政府层面立法取缔中医的行为，对整个中医药体系造成无法弥补的重大损失，流毒深远，现代社会也有那么一些所谓的名人孜孜不倦地试图取缔中医。
那么，现代西医为何如此强势？政治上的因素用不着去讨论，重点在技术和治疗效果上。西医技术和治疗效果那么强势，那是在现代化学、物理学、生物学等学科发展壮大的基础上，西医在医疗器具和化学药物方面全面发展的前提下，才在短短一百来年时间得到高速发展，进而形成一个庞大的、复杂的、内部分工相对独立的医疗体系。