李渊把关于国家大计之事安排完毕，腾出手来，提审阴世师、骨仪等人，最后以“贪婪苛酷，抗拒义师”等罪名，将阴世师、骨仪等十余人斩首，致此杀子之仇、掘坟之恨终以得报。
骨仪被灭全族。阴世师家族中所有成年男性被处死，女眷被贬为奴隶，其幼子阴弘智因年龄尚小而免于一死。
提审犯人时，李渊发现李靖也在狱中，就问李靖是犯了什么罪，怎么被关进了牢狱。李靖淡定的回答道：“没犯什么罪，只是听说你举兵起义，我想要前往江都找炀帝去告你的状，还没来得及出城，就被军卒抓到投入狱中。”
李渊任太原留守时就认识李靖，李靖当时担任马邑郡丞，是郡守王仁恭的副手，他的舅舅韩擒虎是李渊的部将，通过韩擒虎的介绍，两人在工作上有所接触。
关于他们认识的详细过程，正史中并没有过多的记载。不过，后来李靖意识到在马邑无法施展才华，在和李渊的接触中又发觉到李渊有反隋的意图，于是决定前往江都向隋炀帝告发李渊。李靖离开马邑没多久，刘文周杀害郡守王仁恭起兵反隋，李靖侥幸躲过一劫。
行至长安，但因战乱长安城被围困，李靖未能成功赶往江都，而是在长安城里被李渊士兵俘获。
李渊听到李靖要去江都告发他，勃然大怒，立即命人将李靖拉出去处死。
在即将被斩首时，李靖大喊：“公起义兵，本为天下除暴乱，不欲就大事而以私怨斩壮士乎？”
李靖表达的意思是，李渊你发兵起义，本来是为了替天下铲除暴乱，你现在不去想着成就大事，却因为我想要告发你这个私人恩怨，而斩杀我这个壮士吗？
李渊听后，有所犹豫，此时若杀了李靖，自己岂不被人笑话成公报私仇的小人了吗？
正在这时，突然有人进入殿内，大喊“杀不得，杀不得！”
原来是李世民听说李渊要杀掉李靖，慌忙赶来求情。李世民早就听说过李靖，因为韩擒虎和杨素都曾对李靖进行过高度评价。
韩擒虎是隋朝时期的一位着名将领，他以其勇猛和智谋在历史上留下深刻印记。韩擒虎，原名韩擒豹，出生于河南东垣，后迁居新安。他自幼粗犷豪迈，以胆识和谋略着称，体貌魁梧伟岸，喜好读书。北周太祖宇文泰曾夸赞他，并让他与太子们一起游玩，教习武艺。
韩擒虎在军事上取得了非常显着的成就，包括平定北齐、多次挫败陈国进攻，以及在隋朝建立后，作为先锋将军攻打陈国，成功攻破金陵，俘虏陈后主陈叔宝。韩擒虎在隋朝建立后，被隋文帝杨坚任命为庐州总管，负责南方军事要务，为隋朝统一南方立下了汗马功劳。韩擒虎晚年担任凉州总管，最终在隋文帝开皇十二年去世，享年五十五岁。
另外，《隋书》等书籍还编录有韩擒虎成为阎罗王的传说，这个传说在晚唐时期开始流传。相传在韩擒虎病重时，有阴曹地府的使者前来迎接他，称他已被任命为阎罗王。韩擒虎表示愿意接受此职位，他在与隋文帝杨坚告别后，几天后便去世了。还有传说称在韩擒虎临终前，有邻居目睹了他府门前的盛大车马仪仗队伍，认为他是前往阴间的大王。
韩擒虎成为阎罗王的传说不仅反映了人们对于英雄人物的崇敬，也体现了对于死后世界的想象和向往。这一传说在隋唐系列的故事中广为流传，成为韩擒虎形象的一部分，丰富了中国的神话人物形象。韩擒虎成为阎罗王的传说对后世文化也产生了深远的影响，不仅在文学作品中占有一席之地，也在民间信仰和宗教文化中占有一席之地，传递着善恶有报、正义必胜的深刻寓意。
韩擒虎生前经常与李靖讨论兵法，每次交谈都对李靖赞赏有加，认为李靖是唯一一个能与他深入讨论孙子、吴起兵法的人。韩擒虎作为隋朝名将，对李靖的军事才能评价极高，这种称赞体现了李靖在军事理论上有着极深的造诣。
杨素我们前文已介绍过，他生前曾指着自己的座位对李靖说：“卿终当坐此（意为李靖肯定能当上宰相）。”此外，杨素还评价李靖：“可与论孙、吴之术者，惟斯人矣。”这表明杨素不仅认为李靖具有卓越的军事才能，还预见到他在政治上的成就。
李靖能被这两位立下过赫赫战功、位高权重的老前辈夸奖和认可，可见其才兼文武、谋略超群，是出将入相的综合型人才。只可惜，隋炀帝杨广终非伯乐，没有一双慧眼能识贤良之才。
再说李世民进入殿中，力赞李靖是位难得的英才，对唐王劝说道：“父亲大人，韩擒虎、杨素两位老军事家相中的人，绝对不会错，如果能为唐王您所用，必将如虎添翼，立下大功，请父亲赦免李靖，封赐官衔吧。”
李渊听后，沉默良久，最后同意放过李靖，李世民亲自前往刑场给李靖解绑，李靖被召入李世民幕府，开始了他的军事生涯，成为历史中的传奇人物。
至于李渊为何没有爽快地答应放过李靖，后来的史学界认为还有一个原因，即源于李渊曾求助李靖搜集宝马却被拒绝的故事。这件事在《旧唐书》和《新唐书》中均有记载：