王旭彤·蓝风【望月】：（矢吹真吾，不过招式动作表现上面主要以幻影老牛拳为主，草八两人的动作为辅）曹薙京和八神的学弟，因崇拜老牛拳而拜师幻影，这次参加拳皇大赛，主要是想向自己的师傅展示自己现在的实力；
玛丽·忧郁玫瑰【蓝玫瑰】：本是玫瑰家族蓝玫瑰分支的一员，后因男友和父亲的离世而改姓忧郁玫瑰，接连失去家人和爱人，令她的心理大受打击，从那以后，再也没有人看到她的笑容。和特瑞相互之间有好感，也是因为特瑞的出现才让她走出那段阴霾；参加拳皇大赛的主要目的仅仅只是想和特瑞在赛场上打个招呼而已。
——小boSS：高妮珂（设定上为高尼茨的女儿）
【地狱乐队】：克里斯，夏尔美，七枷社
三名来历神秘的孤儿组成的队伍，参加拳皇大赛的目的未知。
——小boSS：千鹤·神乐，
——中boSS：万龟·神乐（伤害加强，防御减弱，智能提高）
——最终对上的是：曹薙京，八神，幻影三人组，胜利后，混沌顺利降临，世界被彻底毁灭。
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特殊剧情队：参与了主线剧情，但是最后对战的boSS均不是混沌势力。
接下来是与主线剧情无关，但也有单独特殊剧情boSS的两支队伍，通关后剧情boSS角色也可选，但也不能用于人与人之间的对战：
【炎皇队】：初始多人对战不可选，用他们队伍通关后才可在多人对战模式里面选择使用他们。
林冬·炎皇【望月】：（原型为K'）望月帝国的皇子，因获知神秘势力妄图通过【混沌】的神力毁灭望月帝国而参加拳皇大赛，力求粉碎对方的阴谋；
马克西·奇迹之炎【望月】：（原型马克西姆）望月“五火球神教”家族一员，林冬的好友，陪同林冬一起找寻那个邪恶的神秘势力；
库拉·冰龙【冰雪】：（原型不用说了吧）林冬的未婚妻，陪同未婚夫一起找寻神秘势力。
——小boSS：古利查力度
——中boSS：零
——大boSS：伊格尼斯
（他们的剧情等于是直接把音巢篇集中到一起了。）
【波动流拳队】隆，肯，春日野樱
为追寻师叔兼仇人【豪鬼】的下落，隆带着师弟肯和徒弟春日野樱一起，沿着收集到的线索参加了本次的拳皇大赛。
——小boSS：维加
——中boSS：豪鬼
——大boSS：获得混沌力量的【神人豪鬼】（出自cApVSSNK2，此战隆的师傅，豪鬼的师兄——刚拳会诈尸复活，和三人一起，四对一打神人豪鬼）。
两个特别队伍：（特别队伍不参与主线剧情，但会作为【炎皇队】的对手，两个队伍的小boSS和自由模式一样随机）
【学院男子队】：来自学院大赛表现最好的三名男同学，剧情简单，就是凑份子参加拳皇大赛过来热闹热闹；
考伯特·电棘刺猬【雄狮】：招式很多雷同97之前的二阶堂红丸，不过出招样式还是和琴·紫雷的做出了改变（琴的招式尤其是必杀技更像99之后的二阶堂红丸），并且不会放雷光拳，而是像波动拳一样把手里的电棘球扔出去伤敌。
费利克·穿山甲【腾龙】：用KoF2003里面神武改的。
尼尔森·大气之云【海山】：这次是拳皇里面的赛斯。
【学院女子队】：来自学院大赛表现最好的三名女同学，剧情同；
玛克辛·赤鸦【火凤】：卡洛琳的学生兼情人，拳皇温妮莎改的，但是出招间加了火焰赤鸦特效。
朱迪丝·束缚之沙【白沙陀】：拉蒙改的，温妮莎队友那个男的独眼龙，加了风沙特效；
伊迪萨·烘焙云米糕【薄雾】：四条雏子改，加了烤炉特效（？）。
所有正统队伍通关后，获得觉醒后的地狱乐队三名角色可选：
克里斯·宿命之炎（控制之火）
夏尔美·荒狂电光（荒狂稻光）
七枷社·干枯大地（干哭大地）
最终boSS混沌过于超纲，无法以任何方法选取使用。
另外，全街霸角色在这自由模式里都可以选择，但是没有单独的剧情。
除了拳皇模式的正统剧情之外，还有单人剧情模式，这个剧情模式基于另一个时空，基于混沌不会降临的平行位面，对战方式为街霸一对一的，目前有单人剧情的仅有十三人，之后会酌情增加，十三人分别为：
曹薙京，八神，特瑞，亮，拳崇，雅典娜，幻影，莉安娜，千鹤，隆，春丽，林冬，七枷社（常态，但可在战斗中切换成干枯大地形态）
每个人各自最终对上的敌人也不尽相同。