江湖暗流涌动之际，林羽与苏瑶回到久别的山居调养休憩。山居静谧，溪水潺潺，仿若世外桃源隔绝纷扰。可这份宁静未持续多久，一日清晨，屋外飞鸟惊起，林羽警觉睁眼，苏瑶亦握紧枕边佩剑。开门瞬间，只见一位断臂独腿的中年剑客单膝跪地，满脸悲戚：“神医侠侣，求你们救救我妻儿！”
原来这剑客隶属偏远门派，近日门派突遭神秘势力血洗，妻儿被俘，自己拼死逃出求一线生机。林羽扶起他，目光决然：“阁下莫急，慢慢说，可知是哪方势力？”剑客咬牙切齿：“虽未看清旗号，但手段阴毒，杀人后还以邪法毁尸灭迹，我暗中瞧见为首之人腰间佩块月牙玉佩。”林羽与苏瑶对视，均觉此事蹊跷，那玉佩似有几分熟悉。
未多耽搁，二人随剑客奔赴事发之地。一路上满目疮痍，村落被焚，田地荒芜，空气中弥漫血腥与焦糊味。临近门派旧址，苏瑶施展灵觉探听，低声道：“四周有隐匿气息，小心埋伏。”林羽轻点首，运功护体。果不其然，刚入山门，利箭如雨，伴着毒烟弥漫。林羽挥袖卷走毒烟，苏瑶银针飞射，将来箭纷纷打落。
闯入内堂，只见厅中妻儿被困在血阵中央，周身环绕诡异红光，一黑袍人负手而立，腰间正是那月牙玉佩。黑袍人转过身，竟是昔日略有交情的江湖客“冷面修罗”，往昔冷峻面容如今扭曲狰狞。“林羽、苏瑶，别来无恙，劝你们少管闲事，否则这二人即刻毙命。”林羽怒目而视：“你为何堕落至此？残害无辜，用这等邪法，到底所图何为？”
“冷面修罗”仰头狂笑：“所图？我不过是想重振声威，这江湖只敬强者，投靠神秘组织，习得这血煞功法，便可称霸武林，你们挡我者死！”说罢，双手结印，血阵光芒大盛，妻儿惨叫出声。苏瑶心急如焚，却被林羽拦住：“别急，破这血阵不能强攻。”他静心凝神，忆起古籍中阵法破解之法，寻到阵眼所在，掌心聚气，推出一道柔和劲气。
阵眼受击，血阵摇晃。“冷面修罗”见状，飞身扑来，掌风携着浓烈血腥味。林羽侧身避开，与其近身缠斗，苏瑶趁机掷出多枚“净化银针”，打入血阵关键节点，血阵光芒渐弱。妻儿脱离危险瞬间，“冷面修罗”分心回望，林羽瞅准破绽，使出全力一击“太极混元掌”，正中其胸口。“冷面修罗”口吐黑血，倒地不起，眼中尚存不甘。
解救了妻儿，林羽却未放松警惕，从“冷面修罗”住处搜出神秘组织指令信函，信中提及下一步计划是突袭江湖各大门派藏书阁，抢夺武功秘籍、医典珍本。“他们野心勃勃，妄图掌控武林命脉，咱们得赶在前面通知各派。”苏瑶忧心忡忡。二人马不停蹄，奔走各派之间，各派掌门起初半信半疑，直至看到信函证据，纷纷警醒，联合布防。
约定之日，神秘组织大军来袭，却发现各大门派严阵以待。一时间，刀光剑影，喊杀震天。林羽、苏瑶穿梭战场，救助伤者、反击敌寇。激战中，林羽窥见组织头目藏身暗处指挥，施展轻功“凌云步”直逼而去。头目大惊，祭出法宝“九幽噬魂幡”，幡影舞动，鬼哭狼嚎，蛊惑人心。苏瑶及时赶到，奏响“清心瑶琴曲”，琴音如水，抵消幡影魔力。
林羽趁机近身，以内力震碎“九幽噬魂幡”，头目慌乱逃窜，却被各派高手围堵。大势已去，神秘组织兵败如山倒。此役后，江湖重归平静，各大门派感恩林羽、苏瑶预警守护，设宴款待。宴会上，林羽举杯：“江湖安宁非一人之功，望往后大家携手，共护江湖正义。”苏瑶浅笑附和，杯盏交错间，新的江湖佳话流传开来，可二人明白，江湖风波无尽，未来仍需枕戈待旦，守护这片热血江湖。
随着江湖渐趋安稳，林羽与苏瑶决定暂别江湖纷扰，回山闭关修炼，钻研医武融合之术，期望突破自身瓶颈。山中岁月悠悠，春去秋来，花开花落，二人武艺、医术皆大有精进。一日清晨，山林间灵雾氤氲，鸟鸣婉转，林羽于溪边练剑，剑气如虹，引得溪水激荡；苏瑶在山洞调配新药，药香四溢，弥漫山谷。
就在此时，一阵急促敲门声打破宁静。开门一看，竟是位稚气未脱小沙弥，手持书信，气喘吁吁：“神医侠侣，少林寺遭遇重创，方丈身负重伤，求二位速去救治！”林羽接过书信，只见信上字迹潦草，透着慌乱，详述少林遭神秘黑衣团伙突袭，寺内秘籍失窃，诸多武僧受伤。“定是江湖余孽作祟，苏瑶，咱们即刻启程。”林羽神色凝重。
二人日夜兼程赶到少林，只见古刹庄严不再，山门破损，庭院血迹斑斑。入内堂，少林方丈面色惨白、气息微弱，周围僧众满脸悲戚。林羽上前把脉，皱眉道：“方丈所中是极为罕见的‘蚀骨绵掌’，掌力侵入脏腑，持续侵蚀，甚是棘手。”苏瑶取出银针：“先以银针封住部分经脉，延缓掌力蔓延。”
施针完毕，林羽又调配解毒祛瘀药膏，亲自为方丈敷上。待方丈稍有起色，询问之下，得知突袭之人个个武功高强，黑衣遮面，招式诡异，临走还留下狠话：“武林秘籍归我，不服者灭门。”林羽心头火起：“嚣张至极，绝不能放过他们。”
循着线索追踪，二人来到一处隐秘山谷。谷中阴森，迷雾重重，隐约可见几座茅屋。靠近时，林羽察觉四周布有奇门遁甲之阵，稍有不慎便会陷入迷障。苏瑶祭出罗盘，依五行方位破解阵法，悄然潜入。屋内，黑衣团伙正围坐商议，桌上堆满失窃秘籍。林羽怒喝：“作恶多端，今日便是你们受罚之时！”
众人受惊跳起，纷纷拔刀。一场恶战拉开帷幕，黑衣人头领使出“幻影刀法”，刀影层层叠叠，如恶鬼扑食；林羽施展新悟“乾坤太极剑”，剑身环绕太极图纹，四两拨千斤，化解刀势。苏瑶在旁以“蝶舞绫罗鞭”辅助，鞭梢闪烁寒光，抽向敌人要害。激战中，林羽瞅准头领换气瞬间，以剑尖挑飞其面罩，竟是昔日叛出师门的败类“狂刀浪子”。
“狂刀浪子”见身份败露，愈发疯狂，祭出绝招“灭世狂刀斩”，刀风呼啸，劈开巨石。林羽、苏瑶联手应对，双掌、长鞭齐出，抵住刀劲。关键时刻，苏瑶甩出“定魂银针”，射中“狂刀浪子”手臂，刀势一偏。林羽顺势全力一击，“乾坤太极剑”贯穿其胸口，“狂刀浪子”倒地身亡，其余喽啰四散而逃。
夺回秘籍，归还少林，寺中僧众感恩戴德，诵经祈福为二人祝愿。经此一役，林羽与苏瑶深感江湖虽历多次整顿，隐患仍存。二人商议后，决定开宗立派，广收门徒，将医武之道传授下去，期望培养一批心怀正义、济世救人的江湖新秀，护这江湖长治久安。
开山收徒当日，各地豪杰、百姓慕名而来，望着台下诸多热忱脸庞，林羽与苏瑶相视一笑，携手开启江湖传承新篇章。往后岁月，门派中弟子研习武艺、医术，时常出山行侠仗义，神医侠侣之名不仅是二人专属，更化作门派精神代代流传，江湖因他们持续焕发生机，故事在热血传承中绵延不绝，直至岁月长河尽头，传奇熠熠生辉。