顾南行自然是有所准备，不管是采用更多赋予军兵权力的制度，还是采用兵户这种历朝历代都用过的制度，他都要进行一次彻底的军改。
当初军队人数少的时候，不管是管理还是纪律，用了他的那套奖惩体系之后，确实发挥了巨大的效果。可是，当军队规模扩大之后，管理体系就根本跟不上了。哪怕是反复进行了普及文化，可是后勤中堪用的人也是完全不够，根本无法有效的运行这套体系。
这是这个时代里受教育人数不足所导致的，从根本上说，如果有人能够当官，那怎么会选择来当兵呢？读过书的游侠儿可真的没那么多，徐庶都是在加入了桃园之后才恶补了大量的知识。
更关键的是，随着军队规模扩大，地方上的岗位数量也已经难以支撑原有的奖惩体系继续提供足够的奖励。
如果奖励体系框架不变，那么军队框架和发放奖励的方式就要变。尤其是职务晋升的方式必须改变，才能让士兵有足够的作战勇气和目标，继续保持作战的动力。
而要改变这些，就必须要进行大规模的组织构架调整。
顾南行没有在现代军队待过，他只知道军衔和职务之间的分离，以及多个层级的现代军队基本概念。
可是，他有经营医院的经验，你看实习医生、主治医师、副主任医师、主任医师等职称，以及各个不同等级的薪资评级，不同的岗位科室。升一级虽然钱没多给多少，但是人们为了潜在的可能性，可是没少花工夫学习和进步呢！
而实际上，医院为此出的成本并不多，反而是通过这种考核用较少的成本激励下属做了更多的工作。
所以，顾南行的改革也是一样的，要激励士兵能去学习读书识字的都去学习读书识字，同时尽量用军中军衔的晋升奖励代替实物奖励，走军衔和职务分开的方法以省钱。
至于具体的办法分成三个方面，官兵分离，衔职分离，兵马结构调整。
所谓官兵分离，就是兵有兵的晋升路线，官有官的晋升路线，士兵要成为军官就必须要有一些硬性条件，比如说能够熟练使用文字等。这样，士兵的赏赐和战利品分润规则也就和军官区分开，自然能够节省一大笔开支。
所谓军衔和职务分离就更好理解了，每个人有一个军衔，这个军衔决定你基本的薪酬和礼仪规制，但是军职决定你的实际职务。军职和军衔没挂钩，但是一般来说军衔不够高不应当得到很高的军职。这样，就有足够的晋升空间提供给军官作为奖励，用荣誉省下一大笔钱。
最后，有了官兵分离和军衔军职分离，那对应的军队结构自然也要调整。尤其是考虑到刘备军是反复扩军的结果，虽然训练规则基本统一，但是不同的部队终究是有差异，还是需要重新整编。
这一次，有这么一个修生养息的机会，那就必须把问题一次性解决。顾南行的方法就是以一营兵为基础进行调整。
以刘备军目前的实力和状态，以及屯住方面的考量，以一千人为营，按照兵种构成分成不同类型的营，营中包括战兵、辅兵、参谋、医师、骡马等一套完整的机构。
这样这些营可以独立进行作战，也可以组合起来结成更大规模的部队进行作战。再加上训练规则和指挥协调统一，可以有效的拆解重组。
其实，这倒不是学什么现代军队组织，一千人是一个县可以供养脱产的职业士兵的极限了，假如还要上供税赋的话。
这样一来，郡兵也可以加入调整，让刘备更好的控制各地郡县。同时可以强化军队的作战能力，让刘备军的精锐得到保存。