漩涡列岛，是城都大陆和湛蓝市之间的41号水路上的一系列群岛。岛屿周围遍布漩涡，难以靠近，因此而得名。
雨轩站在前往漩涡列岛的观光船上，看着海面上的漩涡，感受着大自然的魄力。不禁有些担忧，“这船不会被漩涡吸进去吧！”
“本漩涡列岛观光船，是由经验丰富的舵手在驾驶操控的！我们的系统完善，可以让客人一边观赏充满魄力的漩涡，一边享受船上的旅行。请客人放心，绝对不会出问题的……”从雨轩身边路过的工作人员，听到了雨轩的自言自语，笑着递上一杯果汁，出言安慰道。
“好的，谢谢你的果汁……”其实雨轩倒是不害怕，只是面对不可控的事情，难免有所担心而已，接过服务人员递来的果汁，道了声谢，细细品味起来，却没想到在这艘船上还遇见了熟人。
“雨轩，没想到在这艘船上能遇见你！最近怎么样？徽章收集的还顺利吗？”只见一位抱着太阳珊瑚的男子走了过来，还热情的询问起雨轩的近况。
“哦？是空木博士啊！我还好，徽章收集的也算顺利。哦，对了，你送我的宝可梦蛋已经孵化了，是只可爱的狃拉……”
“哦！原来如此啊！时间过得好快啊！最近我一直在漩涡列岛做调查，现在正要去和船长海德去做独立调查！再也没有比海德船长更加了解这一片海域的了！危险的海涡在这位船长眼里，根本就不足为惧，如果你在漩涡列岛有什么问题，可以随时联系我……”雨轩和空木博士坐在一起喝茶聊起天来，船很快就到达了漩涡列岛的门户之岛，青岩岛。这座岛名字的由来，就是海岸边上的青色岩石。
告别了空木博士，雨轩独自来到了青岩岛上最大的港口城市，库加市。这里到处在张灯结彩，很是热闹，似乎是在举办什么庆典。原来这里正在举办漩涡列岛大赛，大赛是三年举办一次的水系宝可梦格斗大赛，大赛将在一个多月以后举行，可是现在开始岛上就已经热闹了起来，雨轩对此也是很感兴趣，只是水系宝可梦的格斗大赛，不知该派谁出场，还真是有点费脑筋呢！
“欢迎来到青岩岛，请问您是要参加漩涡列岛大赛是不是？”
“是的，麻烦你帮我做一下登记！”青岩岛的宝可梦中心，乔伊小姐为雨轩做了登记，吉利蛋还贴心的送上一份指南书。
“这本书是参加漩涡列岛大赛的规则手册，你可不要遗失了……听说想要专精水系宝可梦的训练家中，有很大一部分，将目标放在了漩涡列岛大赛上，比赛一定会很精彩的哦！期待你的精彩表现哦！”
漩涡列岛大致上分为四个大的岛屿，青岩岛，黄岩岛，赤岩岛，银岩岛。漩涡列岛大赛将会在赤岩岛上举行，在大赛举办之前会举行预赛，淘汰掉一部分参赛者，赢得冠军的训练家，将可以得到岛上传说的头衔，成为水系宝可梦的勇者。这是很久以前，附近的人对于使用水系宝可梦训练家的称呼。他们觉得活在海洋的人，就应该了解水系宝可梦的心。
雨轩在青岩岛的休整期间，不仅让宝可梦们适应了当地的气候和海洋环境，还意外地收获了一些珍贵的水系宝可梦。灯笼鱼，太阳珊瑚，巨翅飞鱼等，可谓是收获颇丰。
这些宝可梦不仅丰富了他的队伍，也为即将到来的漩涡列岛大赛增添了新的力量。随着时间的推移，雨轩逐渐从度假的轻松状态中调整出来，开始更加专注于大赛的准备。
他知道，虽然还有一段时间，但要想在大赛中取得好成绩，就必须提前做好充分的准备。雨轩开始研究漩涡列岛大赛的规则和往届比赛的录像，了解对手的实力和战术。他还组织了一系列的实战训练，模拟大赛的场景，让宝可梦们在实战中锻炼和提高。
在训练中，雨轩发现一些宝可梦在特定的环境下表现出色，而另一些则需要更多的支持和配合。他开始调整战术，让宝可梦们在比赛中能够发挥出最大的潜力。
此外，雨轩还加强了与其他训练师的交流，分享经验和技巧。他从其他人的训练方法中汲取灵感，不断完善自己的训练体系。
“大海是所有生命的起源之地，事物的开头都是最重要的，一旦开始了，就要走下去！不管怎样，敢走的人就赢了！就是不知道能不能幸运的，遇到传说中神秘的宝可梦，会是什么样的宝可梦呢？”
一段时间的休整，在与众多宝可梦训练家的交流中，雨轩不仅收获了不少培育宝可梦的宝贵经验，还听闻了不少这个地方的传说，雨轩自身也有了新的体悟。
在备战的最后阶段，雨轩将所有的准备工作做得尽善尽美。他相信，自己和宝可梦们已经具备了在漩涡列岛大赛中取得好成绩的实力。于是，开始了漩涡列岛的旅途。
在前往黄岩岛的途中，雨轩路过了有名的大波波之岛。岛上除了生活着一群体型臃肿，无法飞行的大波波，以及一名负责照顾它们的工作人员——飞太。
飞太作为宝可梦团体的一员，他明白，每一个生命都应该有自己的梦想和追求，即使在逆境中，也不能放弃自我价值的实现。
通过和飞太的闲聊中，雨轩也了解了飞太和小波波的故事。原来在日常照顾这群大波波幼崽的时候，其中一只特别的波波引起了飞太的注意。