自来也在去雨忍村之前曾经向纲手告白（最终没有说出口）。纲手在自来也走后下了一个赌，她赌自来也不能回来（因为自己逢赌必输，她想让自来也回来），可自来也在与佩恩战斗中沉入海底，下落不明没有回来。[13]在得知自来也死后，纲手伤心不已。
但身为火影的她，很快的收拾心情，一方面安排鸣人前往妙木山修行。另一方面安排人员解读自来也在蛤蟆深作身上遗下的暗号，及解剖其中一名佩恩的躯壳以制订对敌放案。不久之后，“六道佩恩”突然来袭，木叶被佩恩摧毁，身为五代火影的纲手，在叫回鸣人之前使用通灵之术召唤蛞蝓，并把自身的所有查克拉给予蛞蝓，蛞蝓通过分裂到各处为受伤的忍者以及村民进行治疗。
在鸣人与佩恩战斗期间，因她透过蛞蝓为众木叶伤者治疗而耗用大量查克拉，故战后变回老年状态陷入昏迷。火之国紧急会议召开，由于纲手查克拉使用过度昏迷不醒，火之国大名决定选举新的火影，虽然奈良鹿久推荐卡卡西，但大名受暗部“根”领导者志村团藏的控制而任命其为第六代火影（代理），团藏也开始实现他的野心。[16]但团藏却在与宇智波佐助的对战中身亡，苏醒过来的纲手重返火影之位。
旗木卡卡西，火之国木叶隐村的精英上忍，六代目火影，原木叶暗部成员，第四代火影波风水门的弟子，第七班队长，漩涡鸣人、宇智波佐助、春野樱的老师。年仅12岁就成为上忍的天才忍者，后左眼移植宇智波带土的写轮眼，因使用写轮眼复制了上千种忍术而被称为“拷贝忍者”、“写轮眼卡卡西”，其名号响彻各国。第四次忍界大战中，写轮眼不幸被宇智波斑夺去，所幸被鸣人使用阴阳遁将左眼复原。
带土临死前通过查克拉将写轮眼再次赋予卡卡西，使卡卡西可以短暂使用完整的万花筒写轮眼力量，并借此在最终决战与第七班三位弟子一起将大筒木辉夜封印。战争结束后成为了第六代火影，数年后把第七代火影之位交给鸣人，自己和迈特凯两人启程旅行，去寻找曾经的回忆。
木叶隐村的精英上忍，有木叶第一技师之称，精通除血继限界外的上千种忍术。《阵之书》显示拥有七种属性的查克拉。
原木叶暗部成员，第四代火影波风水门的弟子，第七班队长，后因移植宇智波带土的写轮眼，因使用写轮眼复制了上千种忍术而被称为“拷贝忍者”、“写轮眼卡卡西”，其名号响彻各国。
银色长发，带着黑色面罩，身穿黑色紧衣作战服，外部配以绿色的上忍锁甲。双肩与背部纹有暗部的红色标志。笑的时候，眼睛为弯成月牙的弧度。
六代目火影·旗木卡卡西性格特点少年时期：性格冷漠，理性，毒舌，不苟言笑，由于童年的经历（父亲的自杀）封闭了内心的感情，对任务和规则非常执着，但即使如此到了关键时刻还是会选择为了同伴而战。成年时期：温柔阳光与无良腹黑等等，体贴细致（给鸣人送蔬菜、劝说佐助放下仇恨、安慰小樱，在阿斯玛班为了复仇前去挑战晓时主动提出跟随等等）和严厉果断并存。
平日里给人一种懒散、不正经的形象，迟到还说出各种奇怪的借口是常有的事情，但危急时刻十分冷静沉着。卡卡西是一个很坚强的人，即使他的人生中一次又一次的因为各种原因失去了重要的人，他也没有选择憎恨这个世界或者其他人，他总是独守内心的伤痛，并以乐观状态生活。
在续作动画博人传中，卡卡西虽然失去了写轮眼，却凭借实力开发出新术紫电，依然能够使用土遁·土流壁、多重土流壁、螺旋丸等忍术。
血继限界写轮眼三大瞳术之一，是六道仙人长子的后裔宇智波一族的血继限界。具有复制眼、催眠眼、观察眼的强大能力。拥有超乎常人的洞察力，能看穿对手的下一步动作，并且能观察查克拉流动。还可以复制体术和非血继限界的忍术。
写轮眼万花筒写轮眼写轮眼进化的至高境界，通过至亲之人的死来刺激产生极大的负面情绪而开启。眼睛的图案会有所改变。这种写轮眼的瞳力会在普通写轮眼之上，不但原本写轮眼的复制、催眠、观察等能力会提升至最强，而且寄宿着特有的强大瞳术，其瞳术会按照原拥有者擅长的领域开发。
但使用时带有很大的风险和副作用，使用过多还会导致失明。万花筒写轮眼开眼时间：琳撞向卡卡西的千鸟自杀后，和带土同时开启。万花筒写轮眼完全体须佐能乎须佐能乎的真正形态，需要将自身瞳力锻炼到极致，并且拥有极大的查克拉量才能使用。其大小超越山峰，呈现出武神的姿态，其战斗力足以和“尾兽”匹敌。背部的铠甲上变化出的翅膀并配备有双剑，能够翱翔于天际。
完全体须佐能乎能够使使用施术者擅长的忍术，其长剑可以轻松劈开山脉、陨石。完全体须佐能乎神威手里剑将神威的力量注入须佐能乎所投掷的手里剑中，使手里剑变为万花筒写轮眼的形状，并且手里剑射中的目标会被吞噬进异空间。神威手里剑神威雷切卡卡西将神威之力融入雷切中，形成杀伤力更为强大的黑色雷切。被雷切击中的部位会被吸入异空间。
神威雷切须佐能乎·神威雷切让须佐能乎使用神威雷切威力随着须佐能乎的体型而增加。（仅出现在游戏究极风暴4和JUpFoRcE）须佐能乎·神威雷切时空间忍术神威（左眼）神威原本是带土万花筒写轮眼独有的能力，由于卡卡西移植了带土左眼的写轮眼，所以卡卡西也能使用神威。
卡卡西的左眼神威可以远距离将敌人肢体强行扭断送入异空间，也可以传送自己进出异空间。传送的物体大小，是根据施术者的查克拉量来决定的。在原着漫画中，卡卡西用左眼神威先后远距离扭断了迪达拉的手臂和外道魔像的手臂，卡卡西还曾使用左眼神威将附带雷切的苦无转移至异空间。
并且，卡卡西还利用左眼神威将自己从带土的异空间里传送出来。
卡卡西的左眼神威通灵之术c级，既与通灵兽达成契约关系后可以随时随地进行召唤的时空间忍术。
卡卡西的通灵兽为八忍犬，多用于追踪。
雷遁忍术雷遁·千鸟（A）千鸟是少年时期旗木卡卡西开发的雷遁忍术，是卡卡西发现自己无法将雷遁查克拉融入螺旋丸中的缺点后另行开发的雷遁忍术·千鸟，此术兼备查克拉性质变化和形态变化。施术者将雷遁查克拉形成的高强度电流集中在手上配合突刺的速度刺穿目标。由于电流很强会发出如同千只鸟鸣叫的刺耳声，因此得名千鸟。缺点是攻击时需要快速奔向对手，可能会因为速度太快，看不清敌人遭到对方反击，需要配合写轮眼才能发挥最大作用。
雷切（S）雷切是少年时期旗木卡卡西开发的雷遁忍术，据迈特凯所言，千鸟与雷切是同一种忍术，之所以叫雷切是因为卡卡西曾经用千鸟斩断了天上的闪电因此改名为雷切。
苦无雷切卡卡西为了提升雷切的威力在苦无中注入雷切，能够轻松击穿岩石，并且，还可以将附带雷切的苦无甩出去进行远程攻击。在第四次忍界大战中，卡卡西凭借这招对战面具男·宇智波带土。第二次展现时，卡卡西以苦无雷切贯穿了破面带土。
紫电官方小说《卡卡西秘传-冰天之雷》中，卡卡西在失去写轮眼后，开发出的一种不需要依靠写轮眼、并且无需结印就能发动的新型雷遁忍术——紫电。此术有两种发动方式：一种是将紫色雷电集中在手上然后劈砍目标，具有极强的威力。另一种是向四周释放出大范围的紫色电流麻痹对手。范围很广，属于全方位攻击。在续作动画博人传中正式体现。
双雷震（S）雷切的双手版，可攻可守。用双手的雷切抵挡敌人的攻击，可以看到雷电的痕迹。在原着中卡卡西用此术抵消了角都的雷遁·伪暗。
雷兽追牙（c）将雷切进行形态变化，化作狼的形状对敌人展开攻击。雷兽追牙雷传雷切拉成链子，由两个分身拉着，切断对手。雷传雷切·迅将雷遁忍术和苦无相结合，以雷遁查克拉增加手里剑的数目，形成天罗地网般的剑阵。把一枚手里剑分为数以万计，利用神威与雷虎冲击对手，最后一击将雷切形成多个雷球状攻击对手。雷切·迅无属性螺旋丸这是第四代火影·波风水门从尾兽玉中获得灵感、花费三年时间所创造出来的忍术。
将查克拉集中在手上，以不规则的方向不同流动，并加以压缩，形成手掌般大小的查克拉球，攻击对方。被击中后短时间内会造成查克拉紊乱。卡卡西通过写轮眼复制而来，可以单手发动螺旋丸。卡卡西教鸣人学习风遁·螺旋手里剑时曾使用。在博人传中，卡卡西使用螺旋丸为博人演示螺旋丸的威力。螺旋丸土遁忍术
土遁·土流壁（b）通过结印方式将土属性查克拉灌入地面形成竖起的土墙壁。土遁·土流壁土遁·多重土流壁产生多道石壁防御攻击。在博人传中，卡卡西曾使用大范围的多重土流壁。
土遁·裂穿牙潜入地面之下，突然从地面下的突然袭击。
火遁忍术火遁·豪火球之术（c）查克拉聚集在喉咙后，从口中向前方喷吐巨大的火球，将敌人炸飞到空中。（动画原创与究极风暴4使用）
水遁忍术水遁·水龙弹之术（b）利用水环境将湖泊中的水流凝聚为水龙冲击敌人。这是卡卡西在与桃地再不斩的战斗中通过写轮眼复制所学会的忍术。
水遁·水阵壁（b）结印从下而上制造出一道竖起的水墙壁保护自己。在原着中卡卡西曾以此术防御角都的火遁风遁面具怪。