大蛇丸，原火之国木叶隐村的“三忍”之一，与自来也、纲手同为第三代目火影猿飞日斩的弟子。
具有极其强大的实力和近乎于不死的恢复能力。
本身野心极大，擅长研究忍术并渴望得到写轮眼。
由于目睹了太多人的死亡、知道生命是脆弱的而误入歧途，他认为人体中蕴含着一生都无法使用的力量，因此他想获得长生不老从而学习所有忍术，掌握世间的真理。
大蛇丸自幼父母双亡，与自来也、纲手为木叶隐忍者学校的同期学员。
六岁在忍者学校毕业后，被分配到猿飞日斩所带领的班级。
第三代火影·猿飞日斩对大蛇丸的评价很高，称他是“才华洋溢的少年，数十年才出现一个的天才”，因此三代火影非常器重大蛇丸。
这也让自来也对大蛇丸产生嫉妒之意，认为“猿飞老师心中只有大蛇丸一个”。因此在年幼时期，他跟自来也的关系一直处于互相支持，同时也互相竞争的状态，就像你和漩涡鸣人的关系一样。
在一次祭祖之时，第三代火影陪同大蛇丸一起来到大蛇丸父母的坟前，大蛇丸为父母送上了白色的花，途中碰巧遇见白蛇的蜕皮，大蛇丸询问三代火影这是什么，三代火影告诉大蛇丸这是白蛇的蜕皮，白蛇是象征着幸运和再生的东西，十分珍贵，在这里找到也十分幸运。
木叶三忍青年时期，大蛇丸与油女龙马一起担任「根」组织的护卫，陪同志村团藏将有才能的孤儿药师兜作为间谍派往各国。在第二次忍界大战中，木叶与雨隐交战，半藏通灵出山椒鱼井伏释放大范围毒物令木叶大批忍者倒下，最后战场上仅剩下了自来也、纲手、大蛇丸三人仍在坚持，半藏非常赏识他们，因此赋予他们“木叶三忍”的名号。
在返回村子的途中，他们三人偶遇三名雨隐村的孤儿，分别是弥彦、小南和长门。
原本大蛇丸想杀死三个战争孤儿，但他们因为有自来也的维护而存活了下来，更得到自来也传授忍术。这场战役中，自来也、纲手、大蛇丸三人为木叶立下了无数功劳，同时他们三人的名号也威震忍界，然而，不幸的事情也随之来临，自来也接到一个蛤蟆送来的卷轴，他们得知那三个孩子死了，自来也意识到自己曾经的做法是错误的，然而这也是大蛇丸预料之中的事情，毕竟战争是残酷的。
第二次忍界大战结束后，三忍一起来到了牺牲者的坟墓前向他们致敬，纲手问自来也接下来要去做什么，自来也表示还要继续踏在修行的旅途中，自来也认为或许能在某处再次遇到能够改变这个世界的弟子，随后自来也询问大蛇丸难道不打算找后人继承自己的忍道吗，大蛇丸说自己仅有的心愿是能够习得这世间所有的术，然而，纲手与自来也一致认为，就算再怎么精研于术，人的生命也都不会永恒。
渴望长生研究禁术由于大蛇丸目睹了纲手的弟弟绳树、加藤断以及父母的死亡，大蛇丸感觉受到了生命的脆弱，大蛇丸杀死护卫潜入木叶的禁术基地，翻阅了大量忍术卷轴，其中令大蛇丸极为迷恋的是便是第二代火影发明的究极禁术秽土转生，于是，大蛇丸花费多年时间开始学习复活死者的秽土转生以及研究不老不死之术。
期间，大蛇丸曾担任御手洗红豆的老师，是木叶备受尊敬的忍者，也曾经一度被认为是第三代火影的继承者。间接落选与团藏暗中联络在筛选下一任火影之时，团藏曾打算推荐大蛇丸上位以加强自己手中的权力，但三代火影认为大蛇丸眼中隐藏邪恶和野心，不打算将火影的重任托付到大蛇丸身上，于是，木叶高层一同推举自来也的徒弟波风水门，因此，加深了大蛇丸对三代目火影的憎恨。
会议结束后，团藏来到大蛇丸的实验室，大蛇丸认为第三代火影的本意是要将水门当做傀儡，从而师徒一同控制木叶，团藏意识到这样下去木叶迟早会毁灭，大蛇丸表明只要将木遁移植实验研究成功，掌控木叶村的权利简直易如反掌，团藏也为掌控权利等待着时机成熟从而实施强硬手段。