告别了莉拉和亚希达，小智一行人往尼比市的方向前进。
走到一片山区的时候，小智突然看到天空当中出现了一片极光。
小智眉头紧皱，按理说，极光应该是在极地地区才会出现的，怎么会出现在这个地方。
并且，众人发现，像是手机啊，宝可梦图鉴啊，精灵球什么的，全部都不能用了，像是受到了什么严重的干扰。
皮卡丘的情况也很不对劲。
与此同时，小智一行人还遇到了赶来这里调查的宝可梦巡护员日向。
从日向的口中，小智一行人得知，这附近出现了地磁异常的现象，已经持续一周的时间了。
突然，天空中出现了一阵骤变，一只代欧奇希斯突然出现在天空中，但很快就消失不见了。
日向带着小智一行人来到附近的一家宝可梦中心里商讨对策。
宝可梦中心这里的各个系统也都受到影响，无法正常使用。
“以前代欧奇希斯曾经在拉鲁斯市出现过，负责研究的伦多博士在报告中指出，那只代欧奇希斯是跟着陨石一块从太空中过来的。”日向道。
“这个我们知道，毕竟之前拉鲁斯市的代欧奇希斯危机，就是靠小智才解决的。”小遥道。
“什么，原来帮助了伦多博士的那群少年，就是小智你们啊。”日向惊讶道。
“十年前，确实有陨石坠落在这附近一带的山区里，听说还造成了一场大爆炸。”乔伊小姐道。
在询问乔伊小姐得到陨石坠落的位置之后，日向跟小智一行人便来到了一座洞窟里面，在洞窟的深处，果然看到了一颗巨大的陨石。
紧接着，代欧奇希斯突然出现，小智急忙派出喷火龙，压制住了代欧奇希斯。
而日向此时也查明了原因。
因为最近正是太阳黑子爆发的时期，通过检测，这附近地磁异常时的波形与受到太阳风影响时的波形是一致的。
太阳风的影响使得那颗陨石产生了反应，连带着引发了地磁的异常。
而陨石的异常反应，又使得代欧奇希斯痛苦不已。
知道原因之后，小智直接让喷火龙摧毁了那颗陨石，事件就此平息。
代欧奇希斯离开了，地磁也恢复了正常，事情圆满结束。
告别了日向，小智一行人来到了一座小镇，这里有一个黄金树才怪的传说。
之后，小智一行人从一个叫做钦也的男生口中得知，那只黄金树才怪，其实是钦也的宝可梦。
因为钦也为了让树才怪克服怕水的弱点，就拿树才怪去做实验，结果不小心把树才怪变成了全身金黄，树才怪也因此而讨厌钦也，逃走了。
了解到事情的原委之后，小智一行人帮助钦也找到了那只黄金树才怪，然后又帮助他们和好。
钦也早就后悔拿树才怪去做实验了，早已研究出了让树才怪变回来的方法。
树才怪变回原来的样子之后，这个黄金树才怪的传说也就不了了之了。